Väärän Dmitryn kuolema ei lopettanut ongelmia. Sisällissota jatkui, kattaen uusia maita, uusia huijareita. Hallituksensa ensimmäisenä kuukautena Vasily Shuiskyn täytyi tukahduttaa useita Moskovan kaupunkien alemman luokan esityksiä. Moskovassa he pelkäsivät, että Puolan kuningas Sigismund aloittaa sodan huijarin kaatamisesta ja puolalaisten lyömisestä. Siksi useista tuhansista puolalaisista vieraista ja False Dmitryn palkkasotureista, jotka selvisivät toukokuun kansannoususta Moskovassa, vapautettiin vain tavallisia ihmisiä, ja jaloja ihmisiä jätettiin panttivangiksi, heille annettiin hyvä huolto ja jaettiin valvonnassa eri kaupungeissa. Shuisky rikkoi diplomaattisia etikettejä ja jopa pidätti Gonsevskin Puolan suurlähetystön Moskovassa.
Nämä pelot olivat kuitenkin turhia. Puolalla itsellään oli vaikeaa. Puolalaiset aloittivat sodan Ruotsin kanssa ja valloittivat Pernovin (Pärnun) kaupungin häneltä Livoniassa. Lisäksi Hetman Sagaidachnyn johtamat Zaporožje -kasakot suorittivat useita onnistuneita ratsioita ja ryöstivät Kafan ja Varnan. Tämä suututti ottomaanit ja he julistivat sodan Kansainyhteisölle. Totta, Turkin armeijan pääjoukot liittyivät sotaan Persian kanssa ja apujoukkoja lähetettiin Puolaa vastaan, ja puolalaiset torjuivat hyökkäyksen. Puolassa itsessään jotkut magnatit, jotka olivat tyytymättömiä kuninkaan politiikkaan, herättivät raivoa. Maa oli sisällissodan vallassa. Siksi puolalaisilla ei ollut aikaa Moskovaan.
Näin ollen Moskova jätti huomiotta vakavamman uhan - sisäisen. Loppujen lopuksi ongelmia aiheuttaneet ongelmat eivät ratkennut. Ja ulkoinen uhka oli tärkeä, mutta ei päärooli. Maakunta oli raivoissaan: Boyar -duuma valitsi tsaarin ilman tarvittavaa tukea kaikista maista. Kävi ilmi, että bojaarit tappoivat "hyvän tsaarin" ja ottivat vallan ja luovuttivat valtaistuimen "boariaariselle tsaarille". Maakunta kuohui: pakolaisten hakusana nostettiin 15 vuoteen; sotilaat muistivat väärän Dmitryn runsaat palkinnot; etelän asukkaat pelkäsivät kostotoimia ja kauhua (kuten Godunovin aikana) huijarin auttamisesta; huolissaan kasakoista, jotka tukivat aktiivisesti valehtelijaa; Shuisky pääsi eroon False Dmitryn kannattajista lähettämällä heidät pois pääkaupungista, monet lähetettiin eteläisille raja -alueille.
Kesällä 1606 spontaanit kansannousut valtivat koko maan eteläosan, jota levottivat huhut "hyvän tsaarin Dmitrin pelastuksesta". Pohjoisen maan uutta kuningasta vastaan käydyn taistelun keskipiste oli ensimmäisen petoksen "pääkaupunki" - Putivl. Täällä kapinalliset kaupunkilaiset, talonpojat, valitsivat "suuren komentajan" Ivan Bolotnikovin, joka oli tullut heidän luokseen joukolla. Yleisimmän version mukaan Ivan Bolotnikov oli prinssi Telyatevskin orja. Nuoruudessaan hän pakeni isäntänsä aroilta kasakoille, täällä tatarit vangitsivat hänet ja myytiin turkkilaisten orjuuteen. Hän vietti useita vuosia orjuudessa, keittiöissä soutajana. Turkkilaisten epäonnistuneen meritaistelun jälkeen kristittyjen alusten kanssa hän vapautettiin ja suuntautui Venetsiaan, missä hän asui saksalaisessa kauppapaikassa. Täältä kuultuaan tarinoita Venäjän valtion vaikeuksien alkamisesta Bolotnikov muutti Saksan ja Puolan kautta Venäjälle. Huhut Moskovan tsaarin Dmitrin "ihmeellisestä pelastuksesta" vetivät Ivanin Samboriin, missä Moskovan pakolainen Mihhail Molchanov, väärä Dmitri I. Molchanovin entinen liittolainen, piiloutui vaimonsa Juri Mnishek Yadvigan kanssa ja esitteli itsensä kuninkaana. Tämä seikkailija esitteli itsensä Bolotnikoville tsaarina, joka oli paennut toukokuun vallankaappauksen jälkeen Moskovassa. Uusi huijari puhui Bolotnikovin kanssa pitkään ja toimitti sitten hänelle kirjeen prinssi Grigorij Shakhovskylle ja lähetti hänet Putivliin henkilökohtaisena lähettiläänä ja”suurena voivoodina”.
Itse asiassa sisällissota on siirtynyt aktiiviseen vaiheeseen. Bolotnikovin armeijaan kuuluivat Venäjän valtion tärkeimmät kartanot ja sosiaaliset ryhmät: talonpojat ja orjat, Seversk, Terek, Volga ja Zaporožje -kasakat, aateliston edustajat. Lisäksi kansannousua tukivat aristokratian edustajat, muun muassa prinssi Grigori Shakhovsky ja Bolšnikovin entinen omistaja Tšernigovin vaimo Andrei Telyatevsky.
Kesällä 1606 30 tuhatta. Bolotnikovin armeija muutti Moskovaan. Kromyn ja Yeletsin linnoitukset vangittiin, ja niiden rikas arsenaali täydensi kapinallisten varantoja. Ruhtinas Vorotynskyn ja Trubetskoyn kuvernöörien alaisuudessa olevat hallituksen joukot kukistettiin Kromyssä ja Yeletsissä. Monet tsaarin joukkojen sotilaat menivät kapinallisten puolelle. Hyödyntäen tsaarin kuvernöörien virheitä kapinalliset etenivät nopeasti kohti Moskovaa. Yhä useammat kapinallisten talonpoikien joukot tulivat Bolotnikovin armeijaan. Lisäksi matkalla Moskovaan Bolotnikoviin liittyi suuria palvelusherroja, jotka vastustivat poikaarista tsaaria Shuiskyä. Ryazanin vanhempi kuvernööri Prokopy Lyapunov ja nuorempi - Grigory Sumbulov - johtivat Ryazanin miliisiä, jyrkkää sadanpäämiestä Istoma Pashkovia - suurta palvelusjoukkoa. Tula, Kashira, Kaluga, Mozhaisk, Vyazma, Vladimir ja Astrahani kapinoivat. Volgassa mordvalaiset ja marit (Cheremis) kapinoivat ja piirittivät Nižni Novgorodin.
Kapinalliset matkalla Moskovaan lähestyivät Kolomnaa. Lokakuussa 1606 Posad Kolomna otettiin hyökkäyksen kohteeksi, mutta Kreml vastusti edelleen. Jättäen pienen osan joukkoistaan Kolomnaan Bolotnikov suuntasi Kolomna -tietä pitkin Moskovaan. Troitskoje -kylässä, Kolomenskin alueella, hän onnistui voittamaan hallituksen joukot. 22. lokakuuta Bolotnikovin armeija sijoitettiin Kolomenskoje -kylään Moskovan lähellä. Täällä hän rakensi vankilan (linnoituksen) ja alkoi lähettää kirjeitä Moskovaan ja eri kaupunkeihin, joissa kehotettiin tukemaan laillista suvereenia Dmitri Ivanovitšia ja herättämään epäedullisia ja köyhiä rikkaita vastaan. "Te kaikki, bojaarien orjat, lyötte bojaarianne, ottakaa heidän vaimonsa ja kaikki heidän omaisuutensa, kartanot ja kartanot! Teistä tulee jaloja ihmisiä, ja te, joita kutsuttiin vakoojiksi ja nimettömiksi, tappakaa vieraita ja kauppiaita, jakakaa heidän vatsansa keskenänne! Olit viimeinen - nyt saat bojaareja, vääryyttä, voivodikunnan! Suukko koko risti lailliselle suvereenille Dmitri Ivanovitšille! " Siksi Bolotnikovin joukkojen polkua seurasivat kauheat pogromit, ihmiset reagoivat kauhulla terroriin, taistelivat ikään kuin ympärillä olisi vieraita (tsaarijoukot kapinoiden ympäröimillä alueilla toimivat samalla tavalla).
Bolotnikovin miliisi jatkoi kasvuaan, erilliset joukot, pääasiassa orjista, jotka hyökkäyksillään ja ryöstöillään pitivät pääkaupungin piirityksen tilassa, erottuivat siitä. Marraskuussa Ileika Murometsin kasakot liittyivät Bolotnikoviin. Hän oli toinen huijari, joka esiintyi Tsarevich Peter Fyodorovichina, joka todellisuudessa ei koskaan ollut tsaari Fjodor I Ivanovichin poika. Moskovalaiset olivat jo valmiita tottelemaan Bolotnikovia pyytämällä vain näyttämään heille Tsarevich Dmitry ja jopa aloittaneet neuvottelut hänen kanssaan. Iloinen Bolotnikov lähetti sanansaattajia Putivliin. Anna "tsaarin" tulla nopeammin, voitto on lähellä. Mutta Dmitri ei koskaan ilmestynyt. Monet alkoivat epäillä Dmitryn olemassaoloa ja siirtyivät Shuiskyn puolelle.
Samaan aikaan Shuisky ei istunut paikallaan ja valmistautui aktiivisesti vastahyökkäykseen. Moskovan lähiöt ja siirtokunnat vahvistettiin. Kuvernöörien Skopin-Shuiskyn, Golitsynin ja Tatevin joukot asettuivat Serpukhovin portille, josta he tarkkailivat vihollisleiriä. Yhteys Moskovan ja sitä ympäröivien kaupunkien välillä muodostettiin, joukot vartioivat teitä. Marraskuussa vahvistuksia saapui Tveristä ja Smolenskista, jotka koostuivat suurelta osin aatelista ja kaupunkilaisista. Samaan aikaan Shuisky neuvotteli aktiivisesti kapinallisen leirin jaloa osaa vastaan. Lyapunovit ja Pashkov vihasivat Shuiskyä, mutta he pelkäsivät mellakan mellakointia.
Bolotnikovin armeija kasvoi 100 tuhanteen ihmiseen (hänen joukkonsa toimivat suurella alueella), mutta hänen taistelukykynsä heikkenivät. Kapinallisten joukossa oli paljon orjia, kulkureita, talonpoikia, joilla ei ollut taistelukokemusta, heikosti aseistettuja ja organisoituja. Kasakat ja aateliset - kaksi armeijan taistelevaa ydintä, heitä halveksittiin. He kuitenkin myös vastustivat toisiaan. Tämän seurauksena Bolotnikovin armeija jakautui: yksi leiri koostui aatelista ja bojaarilapsista, toinen - orjia, kasakoita ja muita ihmisiä. Jälkimmäisen johtajina olivat Ivan Bolotnikov, entisessä Istoma Pashkov ja Lyapunov -veljekset. Johtajien välillä syntyi erimielisyyksiä, minkä seurauksena ensin Lyapunovit ja sitten Istoma Pashkov siirtyivät Shuiskyn puolelle. Shuisky puolestaan vahvisti Moskovan perusteellisesti ja muodosti uuden armeijan muiden kaupunkien miliiseistä. Lisäksi Shuisky houkutteli monia aatelisia Bolotnikovin leiristä ja lupasi heille palkkion ja rivejä.
Nähdessään tilanteen pahenevan ja Shuiskyn joukot kasvavan, Bolotnikov päätti hyökätä. 26. marraskuuta hän yritti ottaa Simonovin luostarin, mutta tsaarin joukot kukistivat hänet nuoren ja lahjakas komentajan, tsaari Mihail Skopin-Shuiskyn veljenpoika, alaisuudessa. Taistelun ratkaisevalla hetkellä suuri Pashkovin jalo joukko jätti kapinallisten leirin, mikä päätti taistelun lopputuloksen tsaarin armeijan hyväksi. Bolotnikovin joukot olivat juurtuneet Kolomnan leiriin. Skopin-Shuisky piiritti bolotnikovilaiset ja alkoi ampua. Tsaari Vasily yritti sopia itse Bolotnikovin kanssa, lupasi korkean arvon, mutta kapinallisten johtaja kieltäytyi menemästä rauhaan. Kolmen päivän tykistötulen jälkeen Bolotnikovin kirkas armeija ei kestänyt sitä ja pakeni. Osa kasakoista tarttui Zaborien kylään, jossa kapinalliset voitettiin jälleen 2. joulukuuta. Ataman Bezzubtsevin kasakat siirtyivät Skopin-Shuiskyn puolelle. Tsaari Vasily antoi heille anteeksi. Muut taistelussa tai lennon aikana otetut vangit hirtettiin tai tainnutettiin makoilla, hukkui. Bolotnikov pakeni Serpukhoviin, ja sitten Kaluga, Ileika Muromets meni Tulaan.
Näin kapinalliset eivät koskaan voineet ottaa pääomaa. Ratkaisevassa taistelussa tsaarin voivodit voittivat bolotnikovilaiset, mitä helpotti keisari Vassili Shuiskyn puolelle siirtyneiden jalojoukkojen pettäminen.
Kalugassa Bolotnikov keräsi noin 10 tuhatta ihmistä. Tsaarin joukot piirittivät sitä. Pääkomentaja oli kuitenkin tsaari Ivan Shuiskyn lahjakas veli. Tämän seurauksena Kalugan piiritys kesti joulukuusta 1606 toukokuuhun 1607. Kapinalliset puolustivat taitavasti ja epätoivoisesti hyökkäyksiä, torjuivat hyökkäyksiä, ryhtyivät rohkeisiin toimiin aiheuttaen suurta vahinkoa tsaarin joukkoille. Tsaarin kuvernöörit päättivät polttaa puisen linnoituksen ja saivat liikkeelle ympäröivät talonpojat ja alkoivat toimittaa polttopuita, joilla he vuorasivat muurit. Kuitenkin kapinalliset arvasivat tämän suunnitelman ja räjäyttivät "lakaisun" tappamalla ja vammauttamalla suuren joukon tsaarin sotureita. Tällä hetkellä muut kapinalliset yrittivät avata Kalugan, mutta heidät voitettiin. Niinpä Ivan Romanovin armeija voitti Mezetskyn osaston, jonka Shakhovski lähetti Putivlista Bolotnikovin pelastamiseksi. Vyrke.
Myöhemmin Telyatevskin ja Pseudo-Pietarin joukot yrittivät murtautua Bolotnikoviin. 1. toukokuuta 1607 Don ja Ukrainan kasakat voittivat tsaarin joukot Pchelna -joella. Hyödyntäen piiritysarmeijan hämmennystä Bolotnikov teki eron ja voitti tsaarin kuvernöörit, jotka vetäytyivät luopumalla tykistöstä ja matkatavarajunasta. Osa tsaarin joukkoista siirtyi kapinallisten puolelle. Vain Skopin-Shuiskyn rykmentti vetäytyi täydellisessä järjestyksessä. Tämän jälkeen Bolotnikov muutti Tulaan, jossa oli tehokkaampi kivilinnoitus, ja yhdistyi muiden kapinallisten joukkojen kanssa.
Sitten Bolotnikov aloitti toisen kampanjan Moskovaa vastaan. Tsaari Vasily ei kuitenkaan istunut toimettomana."Kunnianosoitus" -henkilöiden ("kunnianosoitus" - kaupunkilaisista ja talonpoikaisyhteisöistä kutsutut soturit) mobilisointi koko maassa ilmoitettiin ja johti henkilökohtaisesti suurta armeijaa, joka oli muodostumassa Serpukhovissa. Kapinan keskukset murskasivat vähitellen. Mellakoijat ajettiin takaisin Nižni Novgorodista. A. Golitsyn voitti Telyatevskin lähellä Kashiraa. Jonkun tuntemattoman Pietarin ilmestyminen odotetun”hyvän tsaarin” Dmitryn tilalle, joka laukaisi terrorin vastustajia vastaan, jäähdytti monia, kapinalliset kaupungit rauhoittuivat ja toivat tunnustuksen. Toukokuussa tsaarin armeija siirtyi kapinallisia kohti. Tsaari itse osallistui kampanjaan, ja yksittäisiä rykmenttejä komensivat Mihail Skopin-Shuisky, Pjotr Urusov, Ivan Shuisky, Mihail Turenin, Andrei Golitsyn, Prokopy Lyapunov ja Fjodor Bulgakov.
Bolotnikovilaiset yrittivät ohittaa tsaarin armeijan pääjoukot ja mennä Moskovaan, mutta ohittamalla Kashira, kapinalliset tapasivat tsaarin armeijan kyljen Vosma -joella. 5.-6.6.1607 käytiin taistelu. Bolotnikovilaisilla oli vahvuusetu - 30-38 tuhatta sotilasta. Kuitenkin Tulan kuvernööri petti Bolotnikovin ja 4 tuhatta. joukko siirtyi tsaarijoukkojen puolelle. Ja Lyapunovin Ryazan -osastot menivät Bolotnikovin armeijan takaosaan. Tämä aiheutti paniikkia bolotnikovilaisten keskuudessa ja he vetäytyivät. Osa Bolotnikovin joukkoista katkaistiin ja vangittiin, vangit teloitettiin. Vosemskin taistelun jälkeen Bolotnikovin armeija ajettiin takaisin Tulaan.
Tsaari Vasily Shuisky lähetti Bolotnikoville useita rykmenttejä Mihail Skopin-Shuiskyn johdolla. Tulan laitamilla Bolotnikov päätti taistella Voronya -joella, kapinalliset sulkeutuivat seriffeillä ja torjuivat pitkään tsaarin ratsuväen hyökkäyksen. Molemmat osapuolet kärsivät suuria tappioita. Kuitenkin jousimiehet tekivät liikenneympyrän, bolotnikovilaiset heiluttivat ja juoksivat, monet kuolivat takaa -ajon aikana. Bolotnikov menetti puolet joukkoistaan näissä taisteluissa - noin 20 tuhatta ihmistä. Muiden kanssa hän lukitsi itsensä Tulaan. Siten Bolotnikov kärsi ratkaisevan tappion ja menetti strategisen aloitteen.
Kesäkuun 30. päivänä tsaari Vasily itse pääarmeijan kanssa lähestyi Tulaa. Aikalaiset kertoivat, että tsaarin armeija oli 100-150 tuhatta ihmistä. Bolotnikovilla ja "Tsarevich Peterillä" on jäljellä enintään 20 tuhatta ihmistä. Piiritysaseet alkoivat ampua kaupunkia molemmilta pankeilta. Tulalla oli kuitenkin voimakkaat linnoitukset, ja Bolotnikoville jäi kapinallisten tehokkain ydin. Siksi piiritetty kesti lokakuuhun 1607 saakka. Piirityksen alkuvaiheessa kaupungin puolustajat tekivät hyökkäyksiä ja puolustivat rohkeasti. Kaikki tsaarin kuvernöörien yritykset valloittaa kaupunki myrskyssä osoittautuivat epäonnistuneiksi.
Sitten tsaarin joukot ajattelivat Boyar Ivan Krovkovin pojan Muromin ajatuksesta estää Upu -joen kaupungin alla padolla, jotta Tula tulvisi. Oikealle, soiselle rannalle pystytettiin noin puolen mailin kokoinen pato, jonka piti estää joen ylivuotaminen alamaahan syksyn tulvan aikana, mutta aiheuttaa jyrkän vedenpinnan nousun. Itse asiassa syksyinen tulva katkaisi kaupungin kokonaan ulkomaailmasta ja muutti sen suomaiseksi saareksi täysin tulvan tasangon keskellä. Monet ammukset vaurioituivat, samoin kuin vilja- ja suolatarvikkeet, jotka oli varastoitu kellareihin. Pian Tulassa alkoi kauhea nälänhätä ja epidemia, mikä pahensi kapinallisten keskinäisiä ristiriitoja. Kapinalliset yrittivät räjäyttää padon, mutta sama Kravkov varoitti Shuiskyä, ja yritys epäonnistui.
Bolotnikov lähetti lähettiläitä Mihail Molchanoville ja Grigorij Shakhovskylle useammin kuin kerran piirityksen aikana, mutta tuloksetta. Ja tsaari Vasily kohtasi uuden uhan. Uusi huijari ilmestyi - väärä Dmitri II, joka oli jo onnistunut valloittamaan Severshchinan, Bryanskin ja Verhovskajan maan. Bolotnikoville tarjottiin neuvotteluja kaupungin antautumisen ehdoista. Shuisky lupasi säilyttää vapauden kapinan johtajille ja osallistujille. Sopimus sinetöitiin juhlallisella valalla, ja 10. lokakuuta 1607 Tula avasi porttinsa tsaarin armeijalle.
Tsaari Vasily petti kansannousun johtajia. Shuisky kiirehti ilmoittamaan, että anteeksianto koskee vain tavallisia "Tulan vankeja", ei kansannousun johtajia. Tulyakit saivat todella anteeksi, kapinalliset aateliset pääsivät pakkosiirtolaisten kanssa. Shakhovskylle annettiin munkki. "Tsarevich Peter" hirtettiin. Bolotnikov lähetettiin Kargopoliin ja hukkui salaa. Monet tavalliset kapinalliset lähetettiin kaupunkeihin, ja ne, jotka päätyivät Moskovaan ilman melua ja pölyä, kuristettiin.
Niinpä Moskovan hallitus sammutti talonpoikaissodan mobilisoimalla käytännössä kaikki varaukset ja vastaten terrorilla terroriin. Kuitenkin Shuisky, joka oli hajottanut suurimman osan armeijasta ja ajatellut, että myllerrys oli päättymässä, laski väärin. Kaikki oli vasta alussa. Toinen väärä Dmitry ilmestyi, johon bolotnikovilaisten jäänteet liittyivät. Puola aktivoitui jälleen.
